Poslanci se snaží prověřit údajné plýtvání penězi v úřadu již od roku 2009, zatím ale neúspěšně. Sněmovna žalobu z letošního ledna proti údajnému nezákonnému zásahu obdržela a má dva měsíce na to, aby se vyjádřila. Vyjádření teprve zpracovává.
Úřad v žalobě navrhuje, aby soud vydal rozsudek ve znění, že "Poslanecká sněmovna Parlamentu ČR je povinna se zdržet nezákonného zásahu do práv NKÚ spočívajícího v zahájení a v kontrole jeho činnosti podle kontrolního řádu Kontrolního výboru PS PČR," uvedla mluvčí NKÚ Radka Burketová. Kdy se soud uskuteční, zatím podle ní jasné není.
Kontrolní řád je dokument, který výbor schválil pro své kontrolní akce, a to v souvislosti s projednáváním kauzy NKÚ.
Prezident úřadu František Dohnal již loni v prosinci sdělil poslancům, že případná kontrola musí mít předem zákonem stanovená jasná procesní pravidla. Sama skutečnost, že kontrolní výbor je oprávněn kontrolovat hospodaření úřadu, ještě podle něj neznamená, že si pro tuto kontrolu může sám stanovit jakákoli pravidla.
Kontrolní řád je podle Dohnala jen interní předpis výboru a v žádném případě nejde o zákon, kterým by se musel úřad řídit. Tím se podle něj plánovaná kontrola od samotného počátku diskvalifikuje na politický proces bez právního významu.
Impulzem pro první kontrolu ze strany poslanců bylo usnesení širšího vedení úřadu, takzvaného kolegia, z jara 2009. V něm obvinili prezidenta úřadu Františka Dohnala z plýtvání penězi. Šlo například o užívání dvou bytů místo jednoho, na který měl nárok. Kvůli tomu už Dohnal stojí před soudem.