Rezignace podle Nantla nesouvisí se čtvrtečním protestem Univerzity Karlovy proti chystané reformě, ale s organizačními změnami v úřadu.
"Vážení a milí, v souvislosti s probíhající organizační změnou jsem považoval za nutné ukončit již dva týdny trvající diskusi mezi panem ministrem, panem náměstkem a mnou tím, že ke dni 31. ledna tohoto roku rezignuji jako ředitel odboru vysokých škol," citoval deník Česká pozice z dopisu, který Nantl rozeslal svým kolegům.
"Ano, je to tak," potvrdil Nantl deníku svou rezignaci s tím, že k jeho odchodu situace spěla již dlouho.
Oba věcné záměry nových zákonů chystané vysokoškolské reformy na začátku ledna odmítla většina akademických senátů univerzit. Univerzita Karlova ve čtvrtek vyzvala vládu, aby novelu neschválila. Nantl na reformě pracoval spolu s náměstkem Ivanem Wilhelmem.