Přestože je v Česku touto bakterií infikováno přibližně jedno až dvě procenta klíšťat, neexistují diagnostické testy, které by onemocnění jí způsobené u člověka odhalily. Přesto touto chorobou ročně trpí až tisíce lidí. Jen o tom nevědí.
U jedinců se sníženou imunitou se po nákaze Borrelií miyamotoi může rozvinout neuroborelióza, kdy bývá napaden nervový systém pacienta a která může mít i trvalé následky.