Britové genom pšenice nerozluštili a přehánějí, tvrdí český botanik

  12:49
Britští vědci nedávno ohlásili, že rozluštili téměř celý genom pšenice. Genetický kód obilovin je nesmírně složitý a pro lidstvo by to znamenalo konec nedostatku potravin ve světě. Ukázalo se ale, Britové zatím udělali jen jeden z kroků. "Genom se rozluštit nepodařilo a touto metodou možná ani nepodaří," upozorňuje jejich český kolega.

Pšenice zůstává pro vědce záhadou. Její genetický kód se zatím rozluštit nepovedlo | foto: Wikimedia Commons

Kdyby se vědcům z Liverpoolu skutečně podařilo rozluštit složitý genetický kód pšenice, lidstvo by se nemuselo obávat nedostatku potravin. Obilovina by se dala vyšlechtit jako odolnější a výnosnější a svět by neohrozily ani takové případy, jako byla sucha v Rusku a následná neúroda.

Jenže je to trochu jinak, vědci se výsledkům přiblížili jen o fous. Žádné převratné objevy rozhodně neučinili.

"Bohužel vědci z Liverpoolské univerzity se zatím zabývali pouze jakýmsi sběrem hrubých dat, která by k přečtení genomu mohla vést. Navíc zvolili podle mého názoru nevhodný postup a dokončení celého projektu sekvenování (termín pro biochemické metody, kterými vědci zjišťují pořadí nukleových bází v DNA - pozn. redakce) genomu pšenice touto strategií bude velmi nesnadné, ne-li nemožné," míní Jan Bartoš z Ústavu experimentální botaniky Akademie věd.

SLOŽITĚJŠÍ KÓD, NEŽ JE TEN LIDSKÝ

Genom pšenice je mnohem složitější než ten lidský. Rozhodně však neplatí, že by pšenice byla složitějším organismem, než je člověk. Velikost genomu totiž nemá žádnou spojitost se složitostí organismu. U některých druhů v průběhu jejich vývoje narostl počet opakujících se motivů a hlavně počet jejich opakování v genomu. Díky tomu mají i některé velmi příbuzné druhy co do velikosti diametrálně odlišné genomy. Genom pšenice navíc vznikl spojením genomu tří velmi příbuzných druhů trav, takže se vlastně jedná o jakési tři genomy v jednom.

Tým vědců v čele s Neilem Hallem navíc svůj objev nezveřejnil ve vědeckém časopise, jak bývá zvykem, ale zprávu rovnou poslal do médií.

Podle Jana Bartoše je genom pšenice nesmírně obsáhlý a je velice složité jej přečíst. "Genetický kód se skládá podobně jako kniha z jednotlivých písmen, v tomto případě čtyř – A, C, G, T, a pořadí těchto písmen v genomu určuje většinu jeho vlastnosti. Úspěšné sekvenování genomu pak představuje přečtení této knihy genetického kódu od začátku do konce," popsal Jan Bartoš s tím, že pšeničný genetický kód obsahuje asi 17 miliard písmen.

Vědci proto musí při čtení těchto kódů pracovat postupně po stech až tisíci písmenech a kód si rozdělit na menší části. "To, co je na sekvenování skutečně složité, je práce s velkým množstvím dat a hlavně nutnost poskládat jednotlivé krátké úseky do pořadí, v jakém se nacházejí v genomu, aby pořadí jednotlivých písmen dávalo správný smysl," dodává odborník na experimentální botaniku.

"Britové šli na dekódování genomu špatně"

Aby toho nebylo málo, některé motivy se mnohonásobně opakují. "Tyto motivy, v knize by to byla slova, se v genomu mohou vyskytovat v stovkách, tisících i desítkách tisíc kopií," vysvětluje Jan Bartoš.

Vědci z Liverpoolu si podle něj práci ztížili, protože použili nevhodný postup. Genetický kód vzali jako celek a získali tak velké množství jednotlivých přečtených částí, ty se pak musí poskládat. To může být u pšenice nemožné, protože tento postup je vhodný pouze pro malé genomy.

"Druhá možnost čtení je zdánlivě zdlouhavější, ale vhodnější. Nejprve se vytvoří jakási kostra z úseku o velikosti kolem sto tisíc písmen genetického kódu. Potom se postupně kratší oblasti genomu do této kostry dosazují. Tím se obchází problémy spojené s velkým počtem opakujících se motivů, které bude právě u pšenice enormní. I mnohem menší genomy rostlin jako rýže nebo kukuřice byly přečteny tímto zdánlivě zdlouhavějším způsobem," představil Jan Bartoš způsob, jakým luští genom pšenice vědci na Akademii věd.

Kdy vědci genom rozluští? Tak za deset let

Tým v Olomouci dělí genom pšenice na jednotlivé chromozomy, tedy jakési kapitoly, které jsou pak čtené samostatně. Jejich skládání by pak nemělo být tak složité. "Toto rozdělení celého genomu na jednotlivé chromozomy, kterých je 21, je naprosto klíčové a stalo se základem strategie, na které se shodli vědci v rámci Mezinárodního konsorcia pro sekvenování genomu pšenice. Naše laboratoř přitom tuto techniku ovládá jako jediná na světě," dodal Bartoš.

Na rozluštění genetického kódu pšenice si tedy bude muset lidstvo nějakou dobu počkat. Podle Bartoše musí vědci po celém světě dostavět "kostry" jednotlivých chromozomů. Poté začnou číst menší části.

"Kdybych se měl pokusit o střízlivý odhad, tak sekvenci prvního z chromozómů můžeme očekávat do pěti let, celého genomu pak do deseti. Výhodou celé strategie je, že rozdělení genomu na chromozomy umožňuje sekvenovat genom pšenice po částech ve více laboratořích a tím postup prací urychlit," uzavřel.

Eurovolby 2024

Volby do Evropského parlamentu se v Česku uskuteční v pátek 7. a v sobotu 8. června 2024. Čeští voliči budou vybírat 21 poslanců Evropského parlamentu. Voliči v celé Evropské unii budou rozhodovat o obsazení celkem 720 křesel

Šebo: Rodiče neočkovaných dětí jsou zločinci, černý kašel je pro kojence smrtící

  • Nejčtenější

V Baltimoru obří loď zbořila dálniční most. Selhal motor, kolos byl neovladatelný

26. března 2024  8:17,  aktualizováno  27.3 1:10

Aktualizujeme V Baltimoru na východním pobřeží Spojených států se v pondělí zřítil čtyřproudový silniční most, do...

Střelba, výbuchy a požár. Ozbrojenci zabili na okraji Moskvy přes 62 lidí

22. března 2024  18:41,  aktualizováno  23.3

Přímý přenos Nejméně 62 mrtvých, včetně dětí, a 146 zraněných si vyžádal ozbrojený útok v koncertním centru na...

{NADPIS reklamního článku dlouhý přes dva řádky}

{POPISEK reklamního článku, také dlouhý přes dva a možná dokonce až tři řádky, končící na tři tečky...}

K útoku u Moskvy se hlásí Islámský stát, teroristé prchli v bílém renaultu

22. března 2024  22:04,  aktualizováno  23.3 7:01

K zodpovědnosti za útok v Krasnogorsku u Moskvy se na ruské sociální síti Telegram přihlásila...

„Ukrajinci to nebyli.“ Islámský stát ukázal video z masakru u Moskvy

24. března 2024  14:47,  aktualizováno  17:17

Islámský stát (IS) prostřednictvím zpravodajské agentury Al-Amaq zveřejnil video z pátečního útoku...

{NADPIS reklamního článku dlouhý přes dva řádky}

{POPISEK reklamního článku, také dlouhý přes dva a možná dokonce až tři řádky, končící na tři tečky...}

ANALÝZA: Čtyři Tádžici svlékli Putina do naha. Ten musí něco udělat

25. března 2024

Premium Sotva týden poté, co si Putin zajistil páté prezidentské období, masakr v Moskvě rozbil moderní...

Tajemný pan Pacička z Tábora. Příběh muže, který spojil velké korupční kauzy

29. března 2024

Premium Dlouhá léta byli hlavními tvářemi velkých kauz v Česku kontroverzní podnikatelé z Prahy. Například...

Útok Hamásu byl ozbrojený odpor, řekla ikona feminismu. Ničíte levici, vyčítají jí

29. března 2024

Premium Jedna z nejznámějších feministických autorek, americká filozofka židovského původu z Kalifornské...

Předali si to v Praze. Německý poslanec Bystroň podle BIS přijal peníze od Rusů

28. března 2024  22:03

Německý poslanec strany Alternativa pro Německo Petr Bystroň byl podle české Bezpečnostní...

Vyřizování účtů, nebo ruská vlivová operace? Polské odvolání generála šokuje

28. března 2024  21:10

Varšava náhle odvolala generála Jaroslawa Gromadzińského z prestižní funkce velitele evropského...

Smoljak nechtěl Sobotu v Jáchymovi. Zničil jsi nám film, řekl mu

Příběh naivního vesnického mladíka Františka, který získá v Praze díky kondiciogramu nejen pracovní místo, ale i...

Rejžo, jdu do naha! Balzerová vzpomínala na nahou scénu v Zlatých úhořích

Eliška Balzerová (74) v 7 pádech Honzy Dědka přiznala, že dodnes neví, ve který den se narodila. Kromě toho, že...

Pliveme vám do piva. Centrum Málagy zaplavily nenávistné vzkazy turistům

Mezi turisticky oblíbené destinace se dlouhá léta řadí i španělská Málaga. Přístavní město na jihu země láká na...

Kam pro filmy bez Ulož.to? Přinášíme další várku streamovacích služeb do TV

S vhodnou aplikací na vás mohou v televizoru na stisk tlačítka čekat tisíce filmů, seriálů nebo divadelních...

Stále víc hráčů dobrovolně opouští Survivor. Je znamením doby zhýčkanost?

Letošní ročník reality show Survivor je zatím nejkritizovanějším v celé historii soutěže. Může za to fakt, že už...