Koordinační a analytickou skupinu zřizuje vláda v červenci roku 1998 vláda. Do čela skupiny se po měsíci jejího fungování staví bývalý ministr bez portfeje Jaroslav Bašta, který dostává za úkol koordinovat akci čisté ruce. Materiály o prvních dvaceti šesti sporných privatizacích připravil pro Baštu ještě Tošovského kabinet.
Přesně rok na to předseda vlády Miloš Zeman poprvé veřejně kritizuje Baštu za to, že „akce Čisté ruce vázne.“ Od té doby vzrůstá napětí mezi Jaroslavem Baštou a Milošem Zemanem.
V listopadu roku 1999 policie zatýká bývalého ministra financí Iva Svobodu a jeho poradkyní Barboru Snopkovou. Zeman prohlašuje, že to je důkaz, že akce Čisté ruce se nevyhýbá nikomu.
Na počátku roku 2000 vydává Bašta prohlášení, kde napadá Miloše Zemana, že za nedostatkem výsledků akce Čisté ruce je dán přístupem Miloše Zemana.
V březnu letošního roku pak Zeman oznamuje personální změny ve vládě. Jedním ze čtyř ministrů, kteří musejí vládu opustit, je i Jaroslav Bašta. O té doby skupina fakticky čeká na své zrušení.
Bývalý ministr a současný poslanec Bašta se však nedomnívá, že by skupina nesplnila to, k čemu byla zřízena. "Myslím, že jsme splnili, co jsme slíbili," řekl Bašta.
Podle Miloše Zemana by dozor nad vyšetřováním hospodářské a finanční kriminality měly převzít specializované útvary vytvořené na státních zastupitelstvích.
Podle opozičních politiků je však dosavadní fungování akce čisté ruce pouze a jenom neúspěchem. "Je to blamáž," říká poslanec za ODS Jan Vidím. "Byla to spíš
Počátkem letošního roku Baštova skupina předala Nejvyššímu státní zastupitelství 233 případů, z nichž bylo 57 odloženo a 122 je dále prošetřováno. Ve 35 případech vznesli vyšetřovatelé obvinění a ve třech byla podána obžaloba. Pro některé z obviněných však čisté ruce stejně rychle skončily jako začaly. „Bývalý ministr Jaroslav Bašta se mi písemně omluvil a tím pro ně celá akce Čisté ruce jednou pro vždy končí,“ prohlásil bývalý šéf Fondu národního majetku Tomáš Ježek, kterého Bašta obvinil ze zneužití pravomocí veřejného činitele v souvislosti s kupónovou privatizací.
Vláda je však s prací Koordinační a analytické skupiny vesměs spokojena.
"Udělali jsme kus práce," míní ministr zemědělství Jan Fencl. "Kdyby nebyla akce Čisté ruce, bylo by to mnohem horší," poznamenal ministr obrany Vladimír Vetchý. "Podle mě tato akce moc účel nesplnila," připustil ministr kultury Pavel Dostál.
Hlavní předvolební heslo ČSSD – akce Čisté ruce však nekončí . Podle vlády přejde na státních zastupitelstva, která se konečně bude moci na ekonomickou kriminalitu lépe soustředit.