Podle zamítnuté novely se měla vyhlašovat chráněná území, která jsou v rámci celé Evropy unikátní pro výskyt vzácných druhů rostlin a živočichů. Vzhledem k našim již dříve kvalitním zákonům, by ovšem většina těchto území nepožívala nové ochrany. Některá naše území v národních parcích, chráněných krajinných oblastech a dalších typech přírodních rezervací by jen dostala modrou nálepku se zlatými hvězdami, což by znamenalo vyjádření zájmu a uznání Evropské unie, i prioritní postavení při využívání různých fondů EU. Je pravdou, že část nově vyhlášených rezervací by byla ustavena zcela nově. Ovšem v mnoha případech, by toto vyhlášení nemělo vliv na využívání těchto území (jak jinak by na nich mohla zůstat zachována příroda splňující kriteria pro zařazení do soustavy evropských chráněných území?).
Hlasování (včetně řady pozměňovacích návrhů) ukázalo, jak hluboko u dna je pro tuto společnost ochrana přírody a jak vážně berou politici své závazky z přístupové smlouvy k EU. Potlesk poslanců ODS po tomto hlasování až mrazí v zádech.
Zamítnutí novely není vítězstvím myslivecké lobby, jak tvrdí ministr Ambrozek, ale je zásadní prohrou právě jeho resortu, který měl novelu asi rok v šuplíku a neustále potichu taktizoval, kdy s novelou do parlamentu vůbec jít. Politika MŽP o Natuře 2000 založená na mlčení a nekomunikaci s ostatními resorty, kraji a vlastníky o významu této novely je tristní. Snaha o nápravu v posledních pár měsících před projednáváním je bohužel v této společnosti snaha sysifovská. Jde o tak významný zákon, že jeho nepřijetí nepřipadá z hlediska našeho vstupu do EU vůbec v úvahu. Pokud nebude v naší legislativě zakotvena soustava Natura 2000, je velmi pravděpodobné, že našemu státu budou významně kráceny nebo úplně zrušeny prostředky ze strukturálních fondů. A to že ostatní země EU budou jenom rády, když pro ně zbude k rozdělení větší balík peněz, není třeba ani dodávat.
Vstup do EU neznamená pouze otevření trhu, ale též zpřísnění zákonů o ochraně přírody. A pokud usilujeme o členství v jakémkoliv klubu, není možné říkat, že některá z jeho pravidel prostě nepřijmeme.