Na postu předsedy AU se pravidelně střídají hlavy jednotlivých afrických států. Funkční období trvá rok a politici v této pozici mají značný vliv na dění v Africe.
Předsedu AU volí Shromáždění hlav států Africké unie. Kaddáfí se na současném summitu zasazuje o ustavení takzvaných Spojených států afrických. Mnoho afrických lídrů není této myšlence příliš nakloněno, v neděli se nicméně dohodli na vytvoření nového orgánu Africké unie, jenž nahradí komisi AU.
Nový orgán by měl být ustaven zhruba v polovině roku a měl by mít poněkud větší pravomoci než stávající komise. Jeho úkolem bude mimo jiné zkoumat, jak nejlépe přivést země afrického kontinentu pod sjednocující vládu.
Myšlenka sjednocené Afriky se táhne od vzniku Organizace africké jednoty v 60. letech minulého století, na niž navázala AU v roce 2001. Mnozí členové unie ale jednotnou vládu AU odmítají, neboť se obávají, že omezí nezávislost jejich zemí. Někteří pozorovatelé navíc kritizují Kaddáfího, že usiluje o vznik "Spojených států afrických", aby je sám mohl řídit.
