Vedení radnice Prahy 6 tvrdí, že nově navrhovaná trasa přes méně obydlené oblasti páté a třinácté městské části je ekologičtější a levnější. Ačkoli je trasa asi o třetinu delší, než původní varianta, díky vyšší možné rychlosti vlaků by prý narostla jízdní doba jen nepatrně.
"Tato varianta se mi začíná zdát reálná a velice levná," uvedl místostarosta Winkler. Rychlodráha přes Prahu 6 by podle něj při splnění podmínek dejvické radnice stála přes deset miliard korun, kdežto trasa vedoucí přes Prahu 5 by byla zhruba o sedm miliard korun levnější. "Metro by však mělo být prodlouženo západním směrem z Dejvické i v případě, kdyby rychlodráha byla postavena," dodal Winkler.
Představitelé Českých drah však jsou jiného názoru. Především proto, že železnice ze Smíchova směrem na Kladno slouží především nákladní dopravě. Pokud by vedla rychlodráha přes Smíchov, hlučnou a prašnou nákladní dopravu by musely dráhy posílat ve směru na Kladno přes Dejvice. "Tím by tato varianta životní prostředí na Praze 6 naopak zhoršila," uvedl mluvčí Českých drah Petr Šťáhlavský.
Návrhem Prahy 6 nejsou nadšeni ani představitelé hlavního města. Primátorův náměstek Martin Hejl uvedl, že by rychlodráha měla sloužit především desetitisícům lidí, kteří se denně přepravují do Prahy z Kladna a okolí. Taková rychlodráha by také uvolnila značně přetíženou Evropskou třídu. Proti trase vedoucí přes Prahu hovoří podle náměstka Hejla především jízdní doba vlaků. "Jízda po trase pražského Semmeringu je sice krásná výletní cesta, ale nevím, jestli by to byla opravdu rychlodráha," řekl náměstek Hejl.
Definitivní rozhodnutí o trase, nebo dokonce o termínu stavby rychlodráhy mezi letištěm v Ruzyni zatím nepadlo. Radnice Prahy 6 ovšem tvrdí, že podle původního projektu, který počítá s trasou přes Ruzyni na Masarykovo nádraží stavět nelze. Tato radnice navíc napadá i dokumentací o hodnocení vlivu na životní prostředí pro výstavbu nového terminálu na ruzyňském letišti, který chce Česká správa letišť stavět kvůli narůstajícímu počtu cestujících. Zástupci radnice soudí, že dokumentace není dostatečná a musí se doplnit. Dokumentace mimo jiné podle radních nehodnotí vliv na životní prostředí od další připravované výstavby na letišti, jako je hotel a parkovací budova.
Podle radnice je nedostatečně zpracován i vliv z nárůstu nákladní dopravy z letiště. Radní se navíc obávají toho, že by připravovaná koncepce letiště mohla zcela znemožnit rozvoj západní části Prahy.
